Добрый день!
Цитата: У нового собственника осталась задолженность перед бывшем учредителем по выплатам в связи с уменьшением уставного капитала.
Нет, у нового собственника не может быть такой задолженности.
Он купил долю у старого собственника, заплатил ему деньги и, если оплата была полная, он ему ничего не должен. На этом их расчеты закончились.
Цитата: осталась кредиторская задолженность перед учредителем.
Цитата: Новый директор утверждает, что купив фирму и заплатив бывшему собственнику, он не должен погашать кредиторку перед бывшем учредителем.
Правильно новый директор рассуждает.
Эта задолженность ООО перед старым учредителем. Новый к ней отношения не имеет.
Разве только, как директор ООО 😀
Цитата: В 2016 году был учредитель принял решение добровольно уменьшить уставный капитал ООО до 10000,00 руб.
Следовательно, задолженность достаточно старая и уже давно должна быть списана.
Цитата: возможно списать кредиторку в связи с истекшим сроком исковой давности в доходы, но тогда надо будет уплатить налог на прибыль.
Да, но это всего лишь 20% от суммы.
А если выплачивать - то все 100% от суммы.
Вариант "обналичить под шумок" я не рассматриваю, поскольку это противозаконно.
Решать Вам, а точнее, новому владельцу.
Успехов!